有在守制的时候得到起复，因此相当于自己现在没有工作，所以不应该要工资。
如此看来，所谓的辞俸守制意思就是在守制期间，官员的禄俸全部都要免除。而之所以要这样做，就是由于张居正没有遵循原有的守制制度。然而，他虽然有这样的心思，明神宗却不可能让这位老臣饿着肚子。于是，明神宗下旨吩咐道：“元辅张先生，俸薪都辞了。他平素清廉，恐用度不足，著光禄寺每日送酒饭一桌，各该衙门每月送米十石、香油三百斤、茶叶三十斤、盐一百斤、黄白蜡烛一百支、柴二十扛、炭三十包，服满日止。”（《张文忠公全集·谢内府供给疏》）皇上实际上是给没有工资的张居正发了额外的补贴，而且补贴得还不少。他对张居正的照顾，由此可见一斑了。其实，这何尝又不是一种交易？你张居正可以为了我明神宗的江山，连给父亲守孝都推去了，我怎么还能不表示一下？搞政治的人就是这个样子，总要在冠冕堂皇的大道理和人之常情之间寻找和谐与平衡，但是却往往因此变得非常虚假，让人觉得少了应有的温暖！然而，这毕竟是皇上的一番美意，作为臣子来说，即便这番美意很虚假，却仍然能让他感恩戴德：“但孤暂留在此，实守制以备顾问耳，与夺情起复者不同；故上不食公家之禄，下不通四方交遗，惟赤条条一身，光净净一心，以理国家之务，终顾命之托，而不敢有一毫自利之心。”（《张文忠公全集·答蓟镇巡抚陈我度言辞俸守制》）在张居正看来，自己在北京守制，与“起复”不同，因此不能享受国家俸禄，只有用心处理国家大事，不敢有一丝一毫的私心。
就这样，张居正开始在北京的家中给父亲“七七”守孝了。在守孝期间，他还是遇到了一些麻烦，主要就是一些大臣出于各种各样的动机和目的上疏弹劾张居正，其弹劾内容大多是针对他的不遵守古制，大逆不道之类的，一度闹得沸沸扬扬！这些事情很快得到了解决，毕竟张居正的背后是明神宗，他的“破坏”传统也是基于明神宗的夺情，因此针对张居正的攻击事实上指向了皇上。至于这些事的结果就很自然了，古老的廷杖制度再次派上了用场。最终，以神宗亲下谕旨，讲明自己的态度和对百官的要求而结束！
七七四十九天的守制看起来时间也不长，可是在明神宗眼里，那可就长了。为什么这样说？很显然，没有了张居正，明神宗可以说是六神无主：有那么多政事需要和张居正商量，可这位首辅却不能在内阁里面办事，因为要守制，内阁的重要公文，一律都送到张居正家中批阅，十分不方便。明神宗盼星星盼月亮似的，数着日子过完了这四十九天。终于到了十一月初，七七日子满了，明神宗兴奋地宣召张居正进宫面圣。
君臣见面，双方都很激动，这在明神宗尤为明显。张居正先开口，来了一段感激肺腑的话：“臣父不幸，仰荷圣恩，赐吊赐赙，又遣官治葬，恤典殊常。臣于国家，未有尺寸之功，叨此隆思，感洞心膂。”
“先生孝情已尽了，”神宗答道，“朕为社稷，屈留先生。先生只想父皇付托的意思，成全始终，才是大忠大孝。”
明神宗始终不忘重新解释何谓真正的忠孝。
听见这句话，不知是什么感情激动了张居正，他的眼角流落了一颗泪珠：“伏奉皇上前后谕旨，委曲恳切，臣愚敢不仰体？又昔承先帝执手顾托，誓当以死图报，今日岂敢背违？但臣赋『性』愚直，凡事止知一心为国，不能曲徇人情，以致丛集怨仇，久妨贤路。今日若得早赐放归，不惟得尽父于微情，亦可保全晚节。”
张居正的意思是说，自己深受先帝和神宗的大恩，自然应该以死相报，不肯违背。但是现在自己由于不循人情，所以得罪了不少人，妨碍了贤才的升迁。因此，他请求神宗让他告老回家，一面可以补上对父亲的孝心，一面也可以保全晚节。
“先生精忠为国的心，”见到张居正哭，神宗也挺动感情地说，“天地祖宗知道，圣母与朕心知道。那群『奸』小人乘机排挤，自有祖宗的法度治他们，先生不必介怀。”
神宗接着转到了正题：“今日好日子，先生可就阁办事。”（《张文忠公全集·谢召见疏》）另外，明神宗还赐给张居正很多财物。对于这些恩赐，张居正一边谢恩，一边准备着重整精神，入内阁处理政务。
有一个问题需要弄明白，张居正这时候究竟是怎样一种心情呢？从表面上看来，他好像已经从先前的悲哀和遗憾情绪之中走出来了。然而，大家不要忘了，张居正的父亲张文明还没有入土为安呢！有着这样的大事在心中，张居正肯定是很难安心工作的。只不过，自己跟明神宗已经约好，七七日期一满，就要回去“为主子服务”。因此，即使自己心中还在牵念父亲的葬礼，也只好暂时搁置一旁，等处理好眼前的一件大事再说。
这是一件什么样的大事呢？它便是前面说到过的万历六年（公元1578年）明神宗的大婚。在万历六年的正月里，司礼监文书官邱得口传了皇太后的慈谕：“这大礼，还著元辅一行，以重其事。”意思就是让张居正全权『操』办儿子的婚礼。
她想到了张居正还在服孝的事情，因此专门叮嘱道：“忠孝难以两尽，先生一向青衣角带办事，固是尽孝；但如今吉期已近，先生还宜暂易吉服，在阁办事，以应吉典，出到私宅，任从其便。”为了她儿子的婚礼，别人就不能尽孝心了！这便是统治者的照顾！
张居正对于这样的要求自然也是无可奈何，只好与英国公张溶一起当上了婚礼大使，张溶为正使，张居正是副使，而且从正月十九日起，就开始穿上了所谓吉利的服装。
经过几个月的精心准备，婚礼的筹备工作基本就绪，就等着吉日的到来了。看着这样的情况，一向住在乾清宫的慈圣皇太后，就决定退居慈宁宫了。她这样做，一方面是遵循古制，一方面是为了将监护明神宗的责任交给张居正。她在走之前，分别给明神宗和张居正下了一道慈谕。给神宗的慈谕内容如下：“说与皇帝知道，尔婚礼将成，我当还本宫，凡尔动静食息，俱不得如前时闻见训教，为此忧思。尔一身为天地神人之主，所系非轻。尔务要万分涵养，节饮食，慎起