受到弹劾官员就得辞职回避等待皇帝的最终裁决。但李三才不仅没有这么做反而“盛气陈辩不自引去”1从而引来了更多的非议和更深的敌意。与此同时顾宪成为了让东林党人在朝廷中争得一席之地以便实现自己的政治主张不顾舆论的喧哗分别写信给辅臣叶向高和掌握吏部铨选大权的孙丕扬一方面为李三才辩白一方面极力称赞李三才廉直可用向他们推荐。这两封信为好事的吴亮附载在邸报上在朝野广为流传结果更使舆论大哗反对者引以为据更加起劲地攻击李三才。乔应甲甚至列出了李三才“十贪”“五奸”的罪状进而展到攻击整个东林党。当时为李三才辩护的人也不少除顾宪成外还有胡忻、曹于汴、段然、史学迁、史记事、马孟祯、王基洪等。这样李三才任用与否的问题实质上演变成为一个东林党与浙党等反对党之间的党争问题了并且成为万历朝东林党与反对党之间最为激烈的一次直接交锋。钱谦益对此曾评论道：李三才一事导致“物议旁午飞章钩党倾动朝野。从此南北党论不可复解而门户之祸移之国家矣”1。面对这种复杂的情况李三才无能为力只好请求罢职。他一连向神宗上了十五次辞职的疏章都没有得到回音他就不等神宗允许自动离职卸任回到通州定居了。结果对什么事都兴趣索然的神宗也没有为此责罚他。
李三才离任回籍之日与当地百姓离别的场面颇让人感动。那天淮、徐一带百姓“老幼提携填街塞巷拥舆不得行。已而相与顶舆号泣一步一吁及抵舟又挟两岸号泣夺缆不得行”2。以后淮、徐一带百姓为了纪念李三才给他们带来的好处集资修建了生祠“聚族为之肖像其中朝夕起拜于其下不绝”3。这些都说明了李三才有良好政绩和威望。
1钱谦益：《列朝诗集小传》丁集中《李尚书三才》。
1钱谦益：《列朝诗集小传》丁集中《李尚书三才》。
2顾宪成：《泾皋藏稿》卷五《与吴怀野光禄》。
3顾宪成：《泾皋藏稿》卷五《与吴怀野光禄》。
李三才回家后仿效顾宪成、高攀龙等在东林书院讲学授徒也在家乡置办起双鹤书院并在那里讲学。但是东林党的反对者们并没有忘记他害怕他东山再起因而继续寻找机会打击李三才而李三才的性格也为这种打击提供了机会。《明史》中《李三才传》评论他“才大而好用机权善笼络朝士抚淮十三年结交遍天下。性不能持廉以故为众所毁”说得不无道理。李三才曾对顾宪成说过他自己“耻效俗人饰边幅装格套于青天白日之下作鬼魅技耳”4。即使与明朝一般的正统、刻板的官僚他也是扞格不入的。有一次颇有政绩的吕坤与李三才论学李三才竟视他为迂阔中途不辞而别。李三才在给神宗的奏疏曾提出过“用人未必贤而必才行”5的观点这一方面是他阳许张居正而同时也是对自己的一个真实写照。在生活上他也是十分豪放的。抚淮时有一次顾宪成路过去拜访他李三才头日招待顾的不过是家常便饭。到了次日他突然盛陈百味顾宪成大惑不解李三才解释说昨天因为没有钱才吃些家常便饭今天偶尔有了就摆了这些菜。《东林列传》的作者陈鼎借此说明李三才善于操纵权机实际上这正是李三才豪放、洒脱、敢说敢为性格的体现。这种性格即使在李三才家居以后也没有丝毫改变。他外出时喜欢有大批追随者和朋友相伴以致他所过之处常常是车马填巷。因而他在家乡建造了较为豪华的住宅也是可信的。而这恰恰为忌恨他的人提供了口实。万历四十二年御史刘光复上疏弹劾李三才盗用皇木和侵占公地来营建私第并且暗里控制着铨部推举之权。李三才只好上疏陈辩请求派人查核。不久其他一些忌恨李三才的人也纷纷诋毁他其中有李三才一手提拔起来的李征仪、聂心汤为此他十分伤心和愤怒更加坚决地请求会勘。神宗命李征仪及吴亮嗣前往勘问。次年劾李三才的刘光复因犯事被关进监狱。李三才表面替刘求情要神宗释放他暗里却竭力地为自己和东林党辩白。同时他又写信给阁臣方从哲公开指斥他“必欲置仆于死地”1。这一切更引起众人对他的不满。会勘的结果自然是不利于他仍以刘光复所陈的事实送呈神宗。神宗至此毫不客气地将李三才落职为民。
天启元年（1621）新兴的后金政权不断骚扰明朝的东北边疆辽东告急。御史房可壮请求起用李三才。于是围绕着李三才的可用与否又掀起一场轩然大波力言宜用者有之力陈不可用者更有之相争不下终究没有结果。天启三年（1623）熹宗重新任命李三才为南京户部尚书他还没来得及赴任就因病离世了。但事情还没有了结不久魏忠贤为的阉党得势全力打击东林党人。李三才被目为东林巨魁而在王绍徽编的《东林点将录》中名列榜从而再次被削籍皇帝给予的封诰亦予剥夺直到崇祯初年才恢复。
李三才有诗才钱谦益的《历朝诗集小传》有他的传陈田的《明诗纪事》卷一一、朱彝尊的《明诗综》卷五二都收有他的诗。他在管理漕务时又有一本记载自己言行的《漕抚小草》陈子龙等编的《明经世文编》卷四二一也选录了他的六篇奏稿。另外据光绪五年的《通州志》1和《明诗综》4顾宪成：《泾皋藏稿》卷六《中丞修吾李公漕抚小草序》。
5陈鼎：《东林列传》卷一六《李三才传》。
1《东林列传》卷十六《李三才传》。
1清光绪《通州志》卷八《人物志·乡贤·李三才传》。
李三才还著有《双鹤轩诗集》、《灼艾集》、《无自欺堂稿》、《诫耻录》和《鹪鹩轩诗集》等可惜现均不存。
第三节杨涟杨涟（1572—1625）字文孺号大洪湖广应山（今属湖北）人。他终生致力于争“梃击案”、“红丸案”、“移宫案”三案以正宫闱反阉党以遏止魏忠贤为挽救混乱的政局献出了自己宝贵的生命。
杨涟的青年时代正是“东林”方兴的时期他对于顾宪成等人以天下为己任、不畏权势、敢于訾议朝政的气节非常敬佩每遇东林讲会他一定千方百计赶到无锡与东林诸君子探讨性理之学共商治国之道。彼此志同道