六世纪伊斯兰教在哈密取得完全支配地位。与此同时伊斯兰教亦在新疆占优势地位。1新疆最大的清真寺——喀什艾提卡尔大寺亦于明代建成。

伊斯兰教在明代从广度和深度上都得到展。

明代一赐乐业教传入中国亦称清真教一赐乐业是以色列的旧译即犹太教与伊斯兰教不相干是论史者所应注意的。

1《新疆简史》第一册第七章新疆社会科学院民族所编著新疆人民出版社1979年版。第五节天主教明代后期西方传教士的来华是中国历史上基督教的第三次传华在影响上远远过了前两次这一次的基督教传华更加突出了中西方文化交流的内涵。明后期基督教传入中国的西方背景是基督教内部的新旧教派之争与地理大现后的海上扩张时期。而当时中国的背景则是宋明理学的一统地位生动摇各种学说兴起传统社会开始向近世转化的时期。

第一个企图打开明朝封闭的大门进入中国的西方传教士是西班牙人方济各·沙勿略（frannetbsp;xavier15o6—1552年）他是当时天主教耶稣会的批成员之一。但是他只到达了靠近广东的上川岛没有进入中国内地就在那里病故了。

就在沙勿略死后第二年明嘉靖三十二年（1553）葡萄牙人行贿于明朝海道副使汪柏借口遇到风暴要求在澳门晾晒浸水货物由此开始进入到澳门。当时正是倭寇经常侵扰福建、广东一带的时候葡萄牙人通过帮助打击海盗取得了明朝廷的信任嘉靖三十六年（1557）被允从上川岛移住澳门。于是耶稣会士也随之进入澳门开始在当地的中国人当中传布天主教。在起初的传教过程中传教士们要求凡是入教的中国人必须先取葡萄牙文的名字学会葡萄牙语从生活上也必须葡萄牙化。这种传教方式不符合当时中国的国情因此几乎无法开展传教工作。耶稣会负责远东事务的意大利人范礼安（a1exan-dreva1ignani1538—16o6年）认为只有按照中国的风俗进行传教才有可能打开中国传教的大门。他的建议得到了耶稣会的批准于是三名传教士从印度被调往了澳门。他们是巴范济（）、罗明坚（）和利玛窦（matthieurinetbsp;罗明坚于万历七年（1579）夏天到达澳门并开始学习汉语言他利用语言的便利结交了明朝的当地官员终于在万历十一年（1583）被获准在广东肇庆居住并且修建了第一座天主教堂。

在最初的传教活动中传教士们尽量去适应中国的习俗他们甚至都穿上中国式的长袍。他们非常善于不露痕迹地宣传基督将圣母和基督的画像放在教堂中任凭来访的中国人跪拜。长期以来中国的多神崇拜使人们并没有对西方的神像产生过多的怀疑。但是后来便生了教堂与当地民众的冲突不同文化的碰撞在这里体现出来。罗明坚在此后虽然受两广总督郭应聘之请到浙江杭州传教但他的传教活动始终没有能够展开。万历十三年（1585）他返回欧洲后没有能够再回到中国他在肇庆建立的第一座天主教堂也在六年后被关闭。但是罗明坚毕竟是明后期第一个在中国传教的西方传教士他不仅印制了《祖传天主十诫》的宣传材料并且是第一个用汉文撰写宣扬天主教教义著作的外国人他在万历十二年（1584）撰写了《天主圣教实录》一书他在书中用文言将天主教的一些名词作了注音及意译对天主教的教义“用适合百姓水平的文体”进行了解释。所以后来人们一直都将他作为明代西方传教士在中国传教的开创者。

罗明坚以后继承他在中国传教的主要传教士便是后来名声颇著的利玛窦。

利玛窦起初作为罗明坚的助手罗明坚走后便成为了当时传教团的主要负责人。他同罗明坚一样非常重视在传教中去适应中国的文化传统穿中式的衣服讲汉语并且研究儒家的经典与明朝的士大夫们交往这一切当然都是为传教服务的手段但是这些手段确实起到了相当大的作用。利玛窦在肇庆时认识了一个名叫瞿太素的士大夫后来利玛窦移居韶州后瞿太素便成为了第一个皈依天主教的明朝上层社会人物是他告诉利玛窦不要穿中国僧人的服装而着儒士服装的。关于瞿太素其人的具体情况史书记述不详《利玛窦中国札记》中说：“他是一个被称为尚书的第二级高官的儿子苏州人是受过良好教育的知识分子。他的父亲因有官职而知名但更因他是三百名应博士学位考试中的魁元而著称。”1这样的人物在当时只有死后被赐尚书的礼部左侍郎瞿景淳《明史》中说景淳有两子：汝稷、汝说。但是当初为景淳作传的王世贞却明确记说他有三个儿子瞿太素便应当是其中的一个。只是因为他后来交结败类沾染恶习有辱家门而不再被人提及了。万历十八年（159o）利玛窦在韶州建立了第二座天主教堂。这次建立教堂与肇庆不同之处在于是它开始有了更多的信徒据记到万历三十五年（16o7）止韶州的教徒已经过八百人。

利玛窦建立的第三座教堂在南昌这是一次计划外的举动。他本于万历二十三年（1595）随侍郎石星前往北京后因石星改变主意而留在南京南京官员又拒绝其住留只得退居南昌于是在南昌开辟了传教事业。

万历二十六年（1598）利玛窦从南昌再次前往北京未成于次年在南京城西建立了第四座教堂。南京是明朝的留都地位仅次于北京南京教堂的建立说明天主教开始进入了明朝的政治文化核心地区并由此而引了明朝高层参与的中西方文化冲突即后来的“南京教案”。然而当时利玛窦对于在南京的活动并不感到满足他一直将传教的目标指向北京。在《利玛窦中国札记》中曾经这样记述了他当时的心情：他在睡眠中做了一个梦梦见他遇到一个陌生的行人向他说：“你就这样在这个庞大的国家中游荡而想象着你能把那古老的宗教连根拔掉并代之以一种新宗教吗？”原来自从他进入中国时起他始终是把他的最终打算当作绝密加以保守的。所以他答道：“你必定要么是魔鬼要么是上帝自己才知道