易生，欲再举，祸已先至，此四难也。以今之计，请调蓟镇、真定、大名、井陉，及督、抚标兵三万，分为三营，令总兵、参、游分将之，而授继光以总理练兵之职。春秋两防，三营兵各移近边，至则遏之边外，入则决死边内，二者不效，臣无所逃罪。又练兵非旦夕可期，今秋防已近，请速调浙兵三千，以济缓急，三年后边军既练，遣还。”（转引自朱东润《张居正大传》）在谭纶看来，蓟辽军队的士兵老弱，大将分散，因此必须加以训练。可是训练却存在着四个大的难题：其一是训练三万人的骑兵每月花费太大；其二是有人非议将南兵与北兵间杂训练的方法；其三是有人会对严峻的军法制造谣言蜚语；其四是担心士兵难以做到失败却不气馁。在这样的情况下，谭纶自然需要得到张居正的帮助了，因为很多问题不是仅靠军事上的改进就能完全解决的，必须依靠政治的力量予以辅助。
对于谭纶的一切需要，身在内阁的张居正几乎是言听计从，一切的困难都帮助其解决。这样，谭纶的北方练兵得到了很好的支持，因而也取得了较大的成效。举例来说，谭纶提议增筑抵御敌人的堡台，张居正立即就回信答应了要求，而且提出了自己的一些审慎意见：“昨议增筑敌台，实设险守要之长策，本兵即拟复行。但据大疏谓一台须五十人守之，则千台当五万人矣。不知此五万人者，即以摆守者聚而守之乎？抑别有增益乎？聚则乘垣者无人，增则见兵止有此数，不知又当何处也？又四面周广，才一丈二尺，虽是收顶之式，度其根脚，当亦不过倍此数耳。以五十人周旋于内，一切守御之具，与士卒衣粮薪水之类，充牣其中，无乃太狭乎？便中仍望见教。”（张文忠公全集《又与蓟辽总管谭二华》）张居正的意思是：谭纶所说的筑台一事，立即就办理，只是还有些疑问需要弄清楚。他不明白，守台的五万人应该怎样防守，是聚守还是其他？为此他提出了疑问。另外，他还觉得所筑之台显得太过狭小，是否能够容纳五十人以及军器粮食等物资。
从这封信我们可以看出，张居正虽然不是军事家，但是他善于用人，在知道部将所需之后，立即予以帮助。不仅如此，他还仔细地询问相关事宜，不耻下问，努力与部将一起干好国防事业。
除了解决谭纶的问题，张居正对于另外一位爱将戚继光也是照顾有加，对于他遇到的政治问题，也是极力帮助其解决。那么，戚继光遇到了什么政治问题呢？上文说道，戚继光从隆庆二年五月起开始总理蓟州、昌平、保定三镇的军事，统管三镇的总兵官。可是，政治上的安排很多时候都不能与实际情况相符合。在戚继光总理三镇的事情上，就出现了这个问题。为什么这样说呢？原来，戚继光虽然总理三镇军事，可是他只能训练三万兵士，可那三个镇的总兵官一共统领着十万人的军队，这样悬殊的力量对比，让戚继光怎样去总理三镇？事实上是无从总理和节制的。因此，戚继光到任后不久就上疏说：“臣官为创设，诸将视臣为缀疣（音同“尤”），臣安从展布？”意思就是在抱怨自己的为难处境。的确，明明有三镇的总兵官，现在又来了个节制总兵官的总理，事情变得复杂起来。
张居正看到戚继光的上疏后也很忧心：设立总理节制三镇总兵官是为了加强监督和军事训练，可是却存在着这样的制度冲突。一时间，他也没了主意。幸好，这个时候突然得知蓟辽总督谭纶对蓟州镇总兵郭琥不满意。于是，张居正就将自己的忧心告诉了时任兵部尚书的霍冀。霍冀是个聪明人，他知道戚继光的问题迟早得解决。因此，他想到了一个“好办法”：既然蓟辽总督谭纶不满郭琥，那就把郭琥解职得了。那谁来坐郭琥的蓟州镇总兵位置呢？很显然，自然是戚继光了！他这样一做，张居正也很满意，满以为自己为爱将解决了一个难题：“戚继光不是觉得自己的兵不多、没有实权吗？这下就给他实权。”
然而，张居正开心得早了点。为什么这样说？因为他得到的关于谭纶对郭琥不满的消息是假的，与此相反，郭琥却是谭纶的一位得力大将。张居正和霍冀的做法，实际上让谭纶、郭琥感到了委屈。而戚继光也因为由节制三镇的总理改任一镇的总兵，尽管增加了实权，但毕竟职位降低了，因而也觉得委屈。这一来，张居正对自己的爱将就犯了一次出于爱心的错误。怎么办？这时候，张居正一个人担起了责任，努力地进行补救。我们不妨来看一下他给谭纶的几封信，从这些信中，我们就可以知道张居正一方面在向自己的爱将细心解释，一方面也在将损失弥补回来：“前闻道体小违和，无任悬念，今想勿『药』矣。近日处分戚帅，诚出下策，然非得已也。顷会霍司马云，‘公本欲论郭琥’，则属者之举，似亦与高见悬符。……但以总理体面，比之镇守为优，今既易衔，则上、下承接，自有常分，用之虽重，而礼则少损矣。昨本兵题复，虑不及此，不知公议疏中，亦可为一处否？如不可处，则于常礼之外，少加优借以鼓舞之。”（《张文忠公全集·与蓟辽总督谭二华》）在这封信里，张居正解释了自己所谓处分戚继光的原因，是因为听信霍司马说谭纶不满郭琥，因而才导致问题发生。现在虽然给了戚继光实权，但是却有损他的体面。因而，张居正写信问询谭纶应该怎么办。
“戚帅以总理改总兵，诚为贬损！缘渠当仆以书相问之时，不急以此意告我，而本兵又仓卒题复，故处之未尽其宜，然及今尚可为也，望公于议疏中，委曲为言。不但体面降抑，为下所轻，且督、抚标兵皆欲付之训练，若不兼总理，何以行便？乞特致一书于阁中二公及虞坡、思斋，仆得从中赞之，更易为力也。倘得如意，当于敕书中增之，其关防当改铸矣。”（《张文忠公全集·又与蓟辽总督谭二华》）这封信里，张居正首先就承认了自己处理戚继光的事情太过仓促，因而没有处理好，希望谭纶能够在上疏中说清楚原因。现在准备让戚继光既当总兵，也当三镇的总理，以使对戚继光的重用实至名归。
仔细阅读这些信件，我们仍然能够感受到张