韬奋创办的《抗战》三日刊合并在汉口出版了《全民抗战》三日刊由邹韬奋任主编沈钧儒任编委。这时救国会已被公认为一个政团沈钧儒和邹韬奋、史良、陶行知等救国会负责人被聘为国民参政员出席了在汉口召开的第一届国民参政会第一次会议。他在会上提出《切实保障人民权利》的重要提案获得许多参政员的赞同。1o月他由武汉到达重庆。
抗战开始后由于形势的改变救国会原有的组织形式已不复存在。1939年在重庆成立了一个“十七人座谈会”由各代表一个方面的“救国会朋友”参加实际上是救国会的核心沈钧儒仍是总负责人。9月在国民参政会第四次大会上各抗日民主党派参政员针对国民党的独裁政策纷纷要求结束国民党一党专政立即实施宪政保障各抗日党派的合法地位。沈钧儒除予以积极支持外还在大会上提出《请政府重申前令切实保障人民权利案》。这次大会通过了实施宪政案。为了促进国内统一、团结和实施宪政11月下旬沈钧儒和黄炎培、章伯钧等人在重庆起组织了统一建国同志会。随后便在重庆、桂林等地开展了宪政运动沈钧儒和救国会是这一运动的积极宣传者和推动者。他表了一系列关于实施宪政的文章和演讲还往桂林推进宪政运动。但蒋介石国民党并不打算真正实行宪政。194o年4月1日国民参政会第五次大会召开由宪政期成会多次研究提出了《中华民国宪法草案（“五五宪草”）修正草案》。对此重要议案根本未经认真讨论蒋介石即作出结论送交政府参考从此便无着落。9月1日国民党中央宣布原定本年11月12日召集国民大会因故改期。这次宪政运动开展不及一年即完全消沉。事实说明蒋介石声称要行宪不过是敷衍舆论的欺骗宣传。
皖南事变后国民党反动派在对实行军事进攻和政治压迫的同2《沈钧儒文集》第3oo、3o2页。
1《沈钧儒文集》第332页。
时对各民主党派和民主人士也采取高压政策肆意摧残民主。黄炎培等一部分小党派参政员为了加强团结合作适应国内政治斗争的需要经过多次会商决定将统一建国同志会改组为一个第三者性质的政治团体并于1941年3月19日在重庆秘密成立中国民主政团同盟。沈钧儒原为创议人之一但一部分起人认为他和救国会同关系密切思想左倾担心国民党反对不赞成他参加。到1942年沈钧儒才正式加入民主政党同盟救国会同时成为盟内政团之一。沈钧儒及其所领导的救国会在争取民主宪政斗争中表现出鲜明坚定的立场使国民党十分恼恨因此在国民参政会第三届名单公布时沈钧儒、邹韬奋、史良、陶行知等全部被除名。1944年9月民主政团同盟为了扩大组织展无党无派的个人盟员以便能让更多的爱国和进步人士参加进来在重庆召开全国代表会议议决取消“政团”二字改称中国民主同盟（简称民盟）。在这次会议上沈钧儒被选为中央常委。1945年1o月1日民盟召开临时全国代表大会通过纲领选举中央执行委员和常务委员沈钧儒继续当选为常委。同年冬救国会在重庆的会员开会鉴于抗日战争胜利结束抗日救亡的政治任务已经完成决定改名为中国人民救国会（仍简称为救国会）并制定了新的政治纲领和组织规程沈钧儒被推选为中央主席。
抗战胜利后沈钧儒要求实现和平民主反对国民党的独裁统治和内战阴谋。1945年一二一流血惨案生后他写诗愤怒谴责国民党的法西斯暴行：“血洒昆明市心伤反战年。座谈讵有罪飞祸竟从天！魑魅食人日鸱枭毁室篇。防川终必溃决胜在民权。”11946年1月沈钧儒作为民盟代表之一参加了在重庆召开的政治协商会议。2月中旬他离开重庆回到上海。为了贯彻政协决议争取国内和平夏秋间他和黄炎培等民盟政协代表往来于京沪间促进国共两党的和平谈判。7月李公朴、闻一多在昆明先后被国民党特务暗杀沈钧儒愤怒写道：“‘民不畏死奈何以死惧之。’杀一二人而要天下再不会有三四人以至百千万人那真是梦想。”211月国民党违反政协决议召开其一手包办的伪“国大”制定伪宪法沈表谈话予以谴责。随后他在上海继续执行律师业务同时参加民盟总部领导工作。
1947年1月沈钧儒出席了民盟二中全会被推为财务委员会主任委员。国民党反动派一方面疯狂进行反革命内战另方面对其统治区加强法西斯专政残酷镇压民主运动。民盟被诬为“奸盟”各地民盟所办报刊全部被查封或被迫停刊一部分盟员和地方负责人被捕被杀。1o月下旬国民党派军警特务包围民盟南京办事处同时宣布民盟为“非法团体”。在国民党的高压政策下民盟中央部分负责人被迫宣布总部同人总辞职总部解散并停止盟员一切政治活动。沈钧儒虽曾提出异议但终因大势所迫无法改变。随后不久他秘密离开上海前往香港。
沈钧儒到香港后与前不久抵港的民盟中常委章伯钧共同主持于1948年1月5日召开了民盟一届三中全会。当日表紧急声明不接受国民党政府宣布民盟为“非法团体”的决定否认民盟总部在被威胁劫持下表的总辞职、总部解散和停止盟员政治活动的声明。沈钧儒在开幕词中说：“我们1《寥寥集》第138页。
2《沈钧儒文集》第524页。
要检讨过去的政纲政策对当前的政治形势重新估计而后确定当前应走的政治路线和新的工作方针来加强本身力量完成政治任务”；并提出全会的使命是“恢复本盟总部继续进行艰巨的政治斗争”1。三中全会通过了政治报告和宣言两项重要文件其主要内容有：（1）指出南京政府“是当前中国民主革命的中心对象”表示要坚定地站在人民的民主的立场跟这个反动集团斗争到底积极支援人民武装革命。（2）认定美帝国主义是国民党反动政权的支持者和靠山必须“坚决驱逐美帝国主义的势力出中国毁灭美蒋所订的一切新不平等条约”。（3）坚决拥护土地改革实行耕者有其田。（4）指出中间路线行不通表示“坚