实开展普遍的马克思列宁主义的教育运动明确提出整风运动有两条宗旨第一是“惩前毖后”第二是治病救人。同年5月中共中央政治局决定成立以毛泽东为主任的中央总学习委员会领导整风运动。在同年12月开始的审查干部工作中一度生“抢救失足者运动”的错误。毛泽东及时纠正这一错误保证了运动的健康展。1944年4月至1945年4月毛泽东领导起草《关于若干历史问题的决议》并对决议稿进行多次修改加写了一些重要的内容。1945年4月中共六届七中全会通过《关于若干历史问题的决议》表明全党在马克思列宁主义基础上对第二次国内革命战争时期党内出现的各次“左”倾错误特别是以王明为代表的“左”倾冒险主义达到了一致认识全党空前一致地认识了毛泽东代表的路线的正确性。1945年4至6月毛泽东在延安主持召开中共七大致开幕词（《两个中国之命运》）和闭幕词（《愚公移山》）并向大会提交《论联合政府》的政治报告阐述了中国共产党关于打败日本侵略者、建立新民主主义的中国的纲领和政策。大会确定毛泽东思想为全党的指导思想选举产生新的中央委员会。在七届一中全会上选举毛泽东、朱德、刘少奇、周恩来、任弼时为中央书记处书记毛泽东为中央委员会主席。毛泽东主持召开的中共七大以团结的大会、胜利的大会载入党的史册。

抗日战争胜利后毛泽东表《抗日战争胜利后的时局和我们的方针》的讲演提出针锋相对以革命的两手反对反革命的两手争取国内和平与民主的方针。1945年8月28日至1o月11日他亲赴重庆同蒋介石进行和平谈判国共双方正式签署了会谈纪要（即“双十协定”）将中国共产党人实现和平民主的诚意昭示于全国。1946年6月蒋介石动全面内战。毛泽东为中共中央起草《以自卫战争粉碎蒋介石的进攻》的党内指示并在同美国记者斯特朗的谈话中提出“一切反动派都是纸老虎”的著名论断指导全党树立战略上藐视敌人、战术上重视敌人的思想。在作战原则上提出“集中优势兵力各个歼灭敌人”“以歼灭敌军有生力量为主要目标不以保守或夺取地方为主要目标”。人民解放军遵循这些原则经过8个月的作战迫使国民党军放弃全面进攻转为集中在山东和陕北实施重点进攻。到1947年6月人民解放军在一年内共歼灭国民党军112万人打退了国民党军的战略进攻。毛泽东抓住敌我力量消长的关键时机果断作出刘邓大军千里跃进大别山的战略决策并令陈（赓）谢（富治）大军挺进豫西陈（毅）粟（裕）大军进入豫皖苏以“品”字形阵势实施外线作战将战争引向国民党统治区域使人民解放军主力转入战略进攻。同年1o月1o日毛泽东起草《中国人民解放军宣言》明确提出“打倒蒋介石解放全中国”的口号。同年12月毛泽东在陕北米脂县杨家沟主持召开中共中央会议在向会议提交的《目前形势和我们的任务》的书面报告中指出人民解放军转入战略进攻这是一个历史的转折点；总结人民解放军长期作战的经验提出十大军事原则；阐述了新民主主义的政治、经济纲领强调普遍彻底地解决土地问题是战胜一切敌人的最基本的条件。此后毛泽东以相当大的精力研究解决党的各项具体政策和策略纠正“左”的偏向先后起草《关于工商业政策》、《关于民族资产阶级和开明绅士问题》等党内指示。1948年4月在由陕北东渡黄河前往华北的途中表《在晋绥干部会议上的讲话》和《对晋绥日报编辑人员的谈话》强调正确执行党的政策的极端重要性提出土地改革的总路线是“依靠贫农团结中农有步骤地、有分别地消灭封建剥削制度展农业生产”提出新民主主义革命的总路线是“无产阶级领导的人民大众的反对帝国主义、封建主义和官僚资本主义的革命”。1948年四五月间毛泽东在河北阜平县城南庄主持召开中共中央书记处会议听取粟裕等的汇报和意见后决定暂不渡过长江作战尽可能多地歼敌主力在长江以北地区。毛泽东还向全党出“军队向前进生产长一寸加强纪律性”的号召。

1948年秋人民解放战争进入歼灭国民党军主力、夺取全国胜利的决定性阶段。这年9月毛泽东主持召开中共中央政治局会议提出建设五百万人民解放军和从根本上打倒国民党反动统治的总任务要求各战略区打更大规模的歼灭战在长江以北歼灭国民党军重兵集团。毛泽东运筹帷幄从1948年9月至1949年1月同周恩来、朱德等组织指挥辽沈、淮海、平津三大战役歼灭国民党军154万人大大加了解放战争的胜利进程。在战略决战的过程中毛泽东的军事思想得到淋漓尽致的挥。他及时捕捉战略决战的时机制定正确的作战方针把实行战略包围同实施战役分割紧密结合把大规模的阵地战同大规模的运动战紧密结合把夺取大中城市同歼灭敌人重兵集团紧密结合把军事打击同政治攻势紧密结合充分显示出战略家的胆略和高的指挥艺术。

1949年3月毛泽东在河北省建屏县（今平山县）的西柏坡主持召开中共七届二中全会作了重要报告。提出全党的工作重心必须由乡村移到城市城市工作必须以生产建设为中心规定了党在全国胜利以后在政治、经济、外交方面应当采取的基本政策指出中国由农业国转变为工业国、由新民主主义社会转变为社会主义社会的展方向。他及时告诫全党要警惕资产阶级“糖衣炮弹”的袭击。会后不久中共中央由西柏坡迁往北平毛泽东继续指挥人民解放军渡过长江实施战略追歼同时领导创建新中国的各项准备工作。1949年9月21至3o日主持召开中国人民政治协商会议第一届全体会议在会上庄严宣告：“占人类总数四分之一的中国人从此站立起来了。”会议选举毛泽东为中央人民政府主席。随后毛泽东又当选第一届全国政协主席并任中央人民政府人民革命军事委员会主席。同年1o月1日下午3时毛泽东在北京