南下攻打南明福王一路由阿济格率领专门攻打李自成大顺军。这年冬天清军动钳形攻势。阿济格和吴三桂、尚可喜率兵经大同向榆林、延安进攻；多铎和孔有德、耿仲明率兵从河南怀庆向潼关进攻。李自成亲自赶到潼关指挥作战依山列阵挖壕树栅预防清兵的冲击。
大顺永昌二年（清顺治二年1645）正月初四日刘芳亮领兵攻击清营。又在五、六两日连夜劫营。十一日清军用炮轰击潼关大顺军骑兵横冲敌军又包抄敌后路取得很大战绩。阿济格和吴三桂部从保德州渡河突破大顺军的北部防线打败李过所部经绥德、延安进逼西安。这时大顺军处于腹背受敌的局面。十三日清军攻进潼关十八日到西安李自成已在五天前撤走。
李自成率大顺军撤离西安后经蓝关出武关向南进入湖广驻扎于襄阳。吴三桂率领清军追击大顺军在邓州、德安、承天等地迎战失利李自成撤出襄阳。时牛金星降清。四月初原明军左良玉部自武昌东下九江。李自成率大军乘虚进驻武昌城大顺军各将领在武昌聚集仍有三十万的兵力。接着大顺军弃武昌南下在富池口与清军一战失败大将刘宗敏被俘牺牲宋献策被俘后降清。大顺军余部转移到湖南后与南明何腾蛟部联合共同抗击清兵。至此大顺政权已不复存在。
关于李自成的结局三百多年来一直是个疑案。官稗史乘众说纷纭。如成书于顺治十五年的《明史纪事本末》记载：“李自成南奔辰州将合张献忠。献忠已入蜀遂留屯黔阳。部贼亡大半然尚拥众十余万。乏食遣贼将四出抄掠黔阳四境鸡犬皆尽。川湖何腾蛟进攻之。自成营于罗公山倚险筑堑为久屯计。势弥蹙食尽逃者益众。自成自将轻骑抄掠何腾蛟伏兵邀之大败杀伤几尽。自成以数十骑突走村落中求食村民皆筑堡自守合围伐鼓共击之。自成麾左右格斗皆陷于淖。众击之人马俱毙村民不知为自成也。截其献腾蛟验之左胪伤镞始知为自成。李过闻自成死勒兵随赴仅夺其尸灭一村而还结草为以衮冕葬之罗公山下。”1而后来纂修乾隆四年刊行的《明史》中则说李自成窜死于湖北通山九宫山。1《明清史料》甲编第一本。
1《明史纪事本末》卷七八《李自成之乱》。
乾隆十一年任澧州知州的何璘根据实地考察所得针对《明史》撰写有《书李自成传后》一文。关于李自成之死由于野史所载不一他特记备考。“余以澧志不备周咨遗事有孙教授为余言：李自成实窜澧州。因旁询故老闻自成由公安奔澧。其下多叛亡至清化驿随十余骑走牯牛坝在今安福县境复弃骑去独窜石门之夹山寺为僧今其坟尚在云。余讶之后至夹山见寺旁有石塔覆以瓦屋塔面大书奉天玉和尚。前立一碑乃其徒野拂所撰文载和尚不知何氏子。夫奉天岂和尚所称？曰玉、曰何氏子盖寓言之亦讳言之也。遍问寺僧对不甚详。内有一老僧年七十余尚能记夹山旧事云和尚顺治初年入寺是律门不言来自何处其声似西人。后数年复有一僧来云是其徒乃宗门自号野拂系江南人事和尚甚谨。和尚卒于康熙甲寅岁三月约年七十。和尚临终有遗言于野拂彼时幼不与闻。奉天和尚为其自号野拂即以名其塔。寺尚藏有遗像命取视之则高颧深■鸱目曷鼻状貌狰狞与《明史》所载相同其为自成无疑。自成之构乱也初僭号奉天倡义大元帅后复僭号新顺王。其曰奉天玉和尚盖以奉天王自寓加点以讳之而玉又玺质天子之所宝殆讫死不去僭号。与泰山贼王同一行径可叹也。而野拂以宗门为律弟子事之甚谨又题称不知何氏子寓尊奉于讳言岂其旧日谋臣相与为左右者欤？”1民国初年章太炎也赞同这李自成禅隐说。并亲自到湖南石门夹山考察访得李自成《梅花百韵》诗五撰写了《李自成遗诗存录》及《再书李自成事》等文。认为李自成窜死九宫山说“无诚证”“不可信”。
二十世纪五十年代初郭沫若为通城县李自成墓题写了墓碑。接着由李文治等几位学者进行了考证认为李自成于1645年5月死于通山县九宫山。为此通山县在九宫山麓修建了“闯王陵”。
八十年代初湖南石门县在夹山寺西坡掘了奉天和尚墓出土了一批珍贵的文物进一步印证了何璘之说不是虚传而是确实可信的。从此李自成禅隐夹山和九宫山被击毙的两种说法并存。
1清乾隆《澧州志林》卷二三。
第二节张献忠张献忠（16o6—1647）字秉吾号敬轩延安肤施（今陕西定边东）
人。与李自成同岁。出身贫苦家庭。从小聪明倔强跟着父亲做小生意贩卖红枣。他当过捕快后又来到延绥镇当一名边兵。生性刚烈爱打抱不平为此几乎丢了性命。他因被人陷害犯了“法”当斩“主将陈洪范奇其状貌为请于总兵官王威释之”1最后以“鞭一百免”2。革役后他逃回到老家。
天启末年陕西全境灾荒不断。陕北又生了严重的干旱和虫灾禾苗枯焦饿殍遍野。农民无法生活下去最终只有铤而走险起来造反。陕北地区先爆了农民起义并很快形成燎原之势。最初有府谷的王嘉胤、王自用起义他们占领了黄龙山。接着宜川王左掛、安寨高迎祥、洛川张存孟、延川王和尚、汉南王大梁等纷起响应斗争烈火燃遍了陕西全境。不久李自成在米脂起义后参加了高迎祥的义军。
崇祯三年（163o）张献忠在家乡聚集十八寨农民也组织了一支队伍响应王嘉胤等起义。他自号“八大王”。由于他“身长瘦而面微黄须一尺六寸僄劲果侠军中称为‘黄虎’”3。这一队伍初属王自用后自成一军。因他小时读过一点书又受过军事训练为人多智谋果敢勇猛很快就显示了指挥才能他的部众成为当时以王自用为盟主的三十六营中最强劲的一个营。从此张献忠随着义军转战于陕西、山西、河南、安徽、湖北、四川等地屡立战功。他的队伍也由几千人展到几万人成为最强大的一支部队。在与官军的作战中起着举足轻重的作用。崇祯六年（1633）冬义军大部分渡过黄河南下张献忠所部是以高迎祥为盟主的十三家之一。
崇祯八年（1635）