张嗣修和张懋修撰殿试策。对于这些诬陷，申时行向神宗解释道：“考官在考察时，只是根据考生的文学技艺水平的高低，并不知道姓名，不宜以此为罪。”最终，那些考官被免了罪，但是何雒文还是被解职了。
“失算”的身后悲凉关于如何对死去的张居正盖棺论定的政治斗争，逐渐导向了不利于张居正的形势。进而，张居正的家人面临着一场严峻的考验——张家被抄。虽然有一些正义之士为张家人求情，然而明神宗却铁石心肠地下令抄家。一场悲剧发生了，这是张居正身前未曾料及的。
这一系列的风波到了万历十二年（公元1584年）时达到了顶峰。
这一年，先是御史羊可立旧事重提，他向明神宗上疏追究张居正在十七年前曾经陷害辽王朱宪。这本来是一件已经盖棺定论的事情了，然而现在却被重新提起。可以想见，当时的『政府』官员正在抓紧明神宗对张居正失去宠信的机会，大肆展开报复行动。
就在羊可立上疏后不久，辽王朱宪的次妃王氏也上疏了，在疏中她一面为辽王伸冤，一面还诬陷说：“庶人金宝万计，尽入居正府矣。”这里的庶人就是当年的辽王。
看到这句话，贪财的神宗终于等不急了，于万历十二年四月下诏令查抄张居正的家产，前去查抄的人有司礼太监张诚、刑部右侍郎邱橓，另外还有锦衣卫、给事中等人。
情势危急之下，一些比较正直，而且跟张居正关系很好的官员，不忍看见张居正家遭此横祸，纷纷上疏请求从轻发落。左都御史赵锦上疏说：“世宗籍严嵩家，祸延江西诸府，居正私藏未必逮严氏，若加搜索，恐遗害三楚，十倍江西民。且居正诚擅权，非有异志，其翼戴冲圣，夙夜勤劳，四外迭谧，功亦有不容泯者。今其官、荫、赠谥、及诸子官职，并从领革，已足示惩，乞特哀矜，稍宽其罚。”（转引自朱东润《张居正大传》）这个上疏的意思是说，就算张居正再怎么腐败，也赶不上严嵩，况且他的专权已经得到了很严重的惩戒，没有必要再抄家了，因此请求从宽发落。
吏部尚书杨巍上疏说：“居正为顾命辅臣，侍皇上十年，任劳任怨，一念狗马微忠，或亦有之。今……上干阴阳之气，下伤臣庶之心，职等身为大臣，受恩深重，惟愿皇上存天地之心，为尧舜之主，使四海臣民，仰颂圣德，则雷霆之威，雨『露』之仁，并行而不停矣。此非独职等之心，乃在朝诸臣之心，天下臣民之心也。”（转引自朱东润《张居正大传》）这个上疏则搬出了张居正以往的功劳，认为他以前还是比较任劳任怨的，因此劝神宗要学习尧舜的仁爱，恩威并施，实质是要神宗从轻发落。
然而，这一切都无济于事。已经动了杀机和贪心的神宗，全然不顾大臣们的劝解，仍旧我行我素，执意要查抄张家。看到向皇上求情已经无效时，申时行等人只好向前去查抄的刑部侍郎邱橓这些人请求手下留情：“圣德好生，门下必能曲体，不使覆盆有不照之冤，比屋有不辜之累也。冀始终留神，以仰承圣德，俯慰人心。”（转引自朱东润《张居正大传》）意思是说，请求这些人手下留情，不要让张家人全部遭难，放掉那些无辜的人。
在这些请求信中，写得最感人的应该是左谕德于慎行的了，他如此写道：“江陵殚精毕智，勤劳于国家，阴祸机深，结怨于上下。当其柄政，举朝争颂其功而不敢言其过，今日既败，举朝争索其罪而不敢言其功，皆非情实也。且江陵平生，以法绳天下，而间结以恩，此其所入有限矣。彼以盖世之功自豪，固不甘为污鄙，而以传世之业期其子，又不使滥有交游，其所入又有限矣。若欲根究株连，称塞上命，恐全楚公私，重受其困。又江陵太夫人在堂，八十老母，累然诸子皆书生，不涉世事，籍没之后，必至落魄流离，可为酸楚。望于事宁罪定，疏请于上，乞以聚庐之居，恤以立锥之地，使生者不致为栾、郤之族，死者不致为若敖之鬼，亦上帷盖之仁也。”（转引自朱东润《张居正大传》）于慎行的意思明显是在褒扬张居正过去的功劳。他认为，张居正在当政时期，的确因为执法严明而得罪了不少人，但是当时没有一人不对他歌功颂德。现在他倒了，大家又群起而攻之。这些行为，实质上都有所偏离事实。张居正身虽死，但还有八十老母和涉世不深的几个儿子，如果抄家就肯定处境凄惨。因此，希望神宗能够“帷盖之仁”。
可是，不管这些求情的言辞有多么感人，邱橓和神宗仍然是不置可否，实际上也就是理都不理。此时的他们，抱持的就是一颗把张居正整得家破人亡的歹毒之心。哪里还会理这些正义之言！
不仅邱橓一干人，就是荆州府和江陵县的官员也闻风而动，在邱橓等还没有到江陵前，就亲自带人把张家给封了。张家被封，吓得张家人都不敢外出。等到五月初五邱橓到了，打开张家大门，就已经饿死十多个人了。
一阵拆屋揭瓦之后，就连张居正兄弟和儿子家的私藏都找了出来，一共才得到黄金万余两，白银十余万两。
但是，贪心的查抄官们还不满意。他们重刑拷打张家人，要其招出寄存在外的二百万两白银。可是，这根本就是莫须有的罪名。张家到哪里去找这些银两？无可奈何之下，查抄官就顺势将罪名栽在了曾省吾、王篆和傅作舟三家人身上。
要想知道当时的惨烈情形，看一下张敬修在临死前写的血书就明白了：“……忆自四月二十一日闻报，二十二日即移居旧宅，男女惊骇之状，惨不忍言。至五月初五日，邱侍郎到府；初七日提敬修面审，其当事噂沓之形，与吏卒咆哮之景，皆生平所未经受者，而况体关三木，首戴幪巾乎！在敬修固不足惜，独是屈坐先公以二百万银数，不知先公自历官以来，清介之声，传播海内，不惟变产竭资不能完，即粉身碎骨亦难充者！且又要诬扳曾确庵（省吾）寄银十五万，王少方（篆）寄银十万，傅大川（作舟）寄银五万，云‘从则已，不从则奉天命行事！’恐吓之言，令人胆落。嗟此三家，素皆怨府，患由张门及之，而又以数十万为寄，何其愚也！吾意三家纵贪，不能有此积，亦不能完结此事，吾后日何面目见之，且以敬修为何如人品也。今又以母、子、叔、侄，恐团聚一