察桃思刺乘机率兵摸上后山自山驰下与高琪合击大破宋军。

卫绍王大安三年（1211）高琪官至泰州刺史、镇州防御使权元帅右都监统领乣军率三千人入卫中都（今北京）。

宣宗贞祐元年（1213）高琪迁元帅右监军。时蒙古军南下他奉诏自镇州（今河北怀来附近）移军守御中都以南地区行至良乡（今北京南）遇蒙古军不得前进返回中都加入京城保卫战。与蒙古军交战高琪每次出击都被击败。把持朝政的太师、尚书令兼都元帅纥石烈执中（胡沙虎）警告他说：“汝连败矣若再不胜当以军法从事。”高琪出战又败自度不能免罪。十月十五日高琪率所将乣军入中都城内围纥石烈执中宅第杀执中持其级诣阙待罪。宣宗虽由纥石烈执中援立即帝位但不满他专权跋扈也有意除掉他。于是赦高琪罪升任左副元帅。不久拜平章政事始掌军政大权。

蒙古军的强大攻势令金宣宗恐惧他不思抗御之策一心想投降、逃跑。一面派人与蒙古议和同时商议迁都。元帅左都监完颜弼奏请弃中都迁往南京开封阻长淮拒大河扼潼关以自固。左丞相徒单镒反对认为聚兵积粟固守京师才是上策。术虎高琪也主张守中都由他转交给宣宗的元帅府官员李英的上书主张中都有居庸关犹如秦之崤、函蜀之剑门若撤居庸兵国势遂去。建议去居庸关组织军民抗击蒙古。宣宗虽接受守居庸关的建议命李英招募抗蒙古军民守关却不许出兵邀击成吉思汗北返军队。虽然百官士庶皆力言不可迁都但宣宗南迁意已决。贞祐二年（1214）五月离开中都迁往南京开封。

南迁后术虎高琪逐渐取得宣宗信任。这时的金朝经济日趋衰败战争浩劫和自然灾害的侵袭更使田畴荒芜饿殍遍野民不聊生。高琪为相后改变世宗以来务行宽厚的政策专尚吏事上下苛察专横逐利除通常所纳赋税之外又计口、计税、计物计生殖之业而加征赋税从而加剧了社会矛盾。

随宣宗由河北入河南的金朝主力军不下数十万高琪以重兵屯驻河南守南京开封以自固不顾华北、东北州县残破各族人民惨遭蒙古军队的蹂躏无意出兵华北抗击蒙古收复失地。贞祐四年（1216）十月蒙古大军取潼关至嵩州、汝州一带台院令史高嶷上书请命平章政事高琪为帅统兵抗击以稳军民之心。被高琪压下不报。御史台也上奏称蒙古军知京师（南京）屯宿重兵故去攻击州县。若朝廷仅以守京城为重中都之危又将再现。请以陕西兵扼拒潼关选京师勇将精兵互为犄角之势且战且守。高琪则以“台官素不习兵备御方略非所知也”。奏请宣宗拒纳宣宗对高琪言听计从一再失去抗御蒙古的战机。

贞祐四年十二月术虎高琪进官尚书右丞相。高琪奏请整修加固南京里城。此时河南人民为养活大批官僚和军队及其家口已不堪负担。连宣宗也认识到“民力已困此役一兴病滋甚矣城虽完固能独安乎？”遂罢是役。

术虎高琪掌握的乣军在宣宗南迁之后不愿再为金朝作战叛金降蒙古。高琪想重新掌握兵权遂积极劝说宣宗攻宋以扩疆土。兴定元年（1217）四月宣宗遣元帅左都监乌古论庆寿、签枢密院事完颜赛不经略南边金宋绝交。十月右司谏许古上疏谏宣宗与宋议和主张采取积极抗蒙古的政策与宋议和以建中兴之功。宣宗命许古起草议和牒文以示宰臣高琪说：“辞有哀祈之意自示微弱不足取。”遂搁置不问。集贤院谘议官吕谘言当议和高琪斥之为狂妄无稽。十二月平章政事胥鼎上书言出兵攻宋六不可以为只当遴选将士分布近边州郡敌至则追击去则力田以广储蓄。国用丰饶自可恢复先业成中兴之功。高琪无视所言利弊说“大军已进无复可议”。

兴定元年（1217）宣宗下诏攻宋兵分两路。东面初以乌古论庆寿、完颜赛不为统帅开始连败宋军于陇山、七里山等地攻占光山、罗山、定城等县但在枣阳为宋军内外夹攻所败。兴定二年再围攻枣阳被宋击败。兴定三年至五年金再次动空前猛烈的攻势以完颜讹可为统帅金宋双方互有胜负。西面兴定元年由秦、巩、凤翔三路并进元帅完颜承裔等取宋大散关侵四川破天水军。兴定二年焚大散关屯边隘。四月又破大散关攻入西和、成、阶等州得粮九万斛钱数十万军需无数。兴定三年被宋张威击退。宣宗多次出兵攻宋遭到宋军及抗金民兵顽强抵抗虽有小胜但终不能南下。金朝兵力梢耗很大北面无力抗击蒙古南面侵宋拓疆又不成金朝统治已处在摇摇欲坠之中。

术虎高琪任宰相以来专固权宠擅作威福附己者用不附己者斥凡言事忤意皆欲置于死地。贞祐初年中都书生樊知一诣高琪言乣军不可信恐生乱。高琪以刀杖决杀之自此无人敢言军国利害。若大臣中有才能但不附己或才能与己抗衡者高琪便对宣宗阳称其才使于河北抗蒙古阴置之死地。兴定二年（1218）宣宗召集百官议河北、陕西守御抗敌之策高琪心忌之不用一言。高琪擅权严重威胁了宣宗的权威因而宣宗对高琪也感到不满。贞祐三年（1215）应奉翰林文字完颜素兰见宣宗密奏：“高琪本无勋望向以畏死擅杀胡沙虎（纥石烈执中）计出于无聊耳。妒贤能树党与窃弄威权自作威福此贼灭乱纪纲戕害忠良实有不欲国家平治之意。”请宣宗除之。宣宗听后说：“以乃大事汝敢言之甚善。”并嘱素兰“慎无泄也”。兴定二年高琪主张筑开封里城言“正使（蒙）兵来臣等愈得效力。”宣宗言：“与其临城曷若不令至此为善。”表示了对高琪不用群臣守御河北、陕西之策而欲修筑南京里城的不满。

兴定三年（1219）九月宣宗次子平章政事英王完颜守纯欲揭高琪罪状密召右司贝外郎王阿里、知案蒲鲜石鲁刺、令史蒲察胡鲁商议。石鲁刺、胡鲁把此事告诉尚书省都事仆散奴失不奴失不却告知高琪。英王守纯惧高琪及其党羽势力未敢行事。不久高琪使家奴赛不杀其妻并归罪于赛不送开封府杀之以灭口。事被觉后宣宗便以此为由诛高琪时为兴定三年十二