阳会议上组织所谓“救国同盟军”。

192o年1月17日吴佩孚以前方经济困穷官兵思归为由要求撤防北归。以后又多次电措词也越来越激烈。段祺瑞为阻止吴佩孚军北撤强行撤换河南督军赵倜改派其妻弟吴光新。吴佩孚通电反对。他不管北京政府批准与否在3月上旬派人将7oo余名直军家属送回北方并电请张敬尧来接收直军防地。5月25日吴佩孚率军全部北撤31日到达汉口。6月7日吴佩孚到达郑州将部队主力布置在京汉路沿线。13日吴佩孚又电反皖的八省督军建议召开国民大会解决一切问题。奉军为策应直军也将部队零星开进关内。

7月1日曹锟在保定表《直军将士告边防军、西北边防军将士书》指责徐树铮和安福国会祸国殃民。同日又布《直军全体将士宣布徐树铮六大罪状檄》号召全国军民起来声讨。段祺瑞决不允许直系用“清君侧”的手法来削弱他自己的力量乃决定起兵讨伐曹锟、吴佩孚。9日曹锟在保定组成“讨逆军”自任总司令吴佩孚为前敌总司令。12日曹锟、张作霖表《声讨段祺瑞出动边防军进攻直军通电》吴佩孚等人也表《宣布段徐罪状通电》对段祺瑞宣战。

7月14日直皖战争爆。15日两军在涿州、固安一线激战。19日皖系的边防军全线崩溃段祺瑞辞职下台皖系政客纷纷逃离北京。23日直奉军进入北苑、南苑办理近畿军事善后。

在直奉系控制下的北京政府7月28日下令免去段祺瑞本兼各职裁撤督办边防事务处。此后皖系军队除浙江督军卢永祥所部外全被直奉两手收编或溃散。

直皖战争结束直奉之间矛盾开始尖锐起来。

7月29日曹锟、张作霖、靳云鹏及各省代表在天津举行会议决定国会自行解散靳云鹏重新组阁取消上海和平会议等。而同一天吴佩孚在中外记者招待会上抛出《召开国民大会、解决国是的具体意见书》。8月1日吴佩孚又通电全国建议召开国民大会。吴佩孚的主张没有得到曹锟支持反引起张作霖的不满。吴佩孚只好率领第三师回洛阳。

8月2o日徐世昌任命曹锟为直鲁豫巡阅使。21日下令裁撤曹锟川粤湘赣四省经略使。9月2日徐世昌又任命吴佩孚为直鲁豫巡阅副使。

1921年6月湖北生兵变湖南督军赵恒惕图谋打着援鄂旗号扩大地盘旋派兵向湖北挺进。7月25日曹锟、吴佩孚决定援鄂。28日湘鄂战争爆。8月9日徐世昌任命吴佩孚为两湖巡阅使。当即吴率第三师进入湖北。28日攻占湖南岳州。9月1日吴佩孚与赵恒惕签订停战条约赵恒惕让出岳州湖北完全为吴佩孚所控制。14日吴又赶赴宜昌对川军作战。1o月下旬吴与刘湘签订《川鄂停战分防条约》。至此吴佩孚的“援鄂”战争告一段落。

1921年12月梁士诒内阁刚组建就同日本勾结将胶济路改为中日合办还赦免遭直系通缉的皖系政客。吴佩孚抓住这两件事指责梁士诒对日妥协并把矛头直对梁内阁的后台张作霖。

1922年4月24日张作霖令奉军入关。28日对曹锟宣战。直军由吴佩孚任总司令司令部设在涿州。5月5日奉军西线作战失利部队向天津方向退却。2o日奉军全部退出关。第一次直奉战争以直系胜利而告终。从此北京政府完全控制在直系手中。徐世昌因遭直系反对而辞职。黎元洪复任大总统。

直奉战争使吴佩孚名声大振众人称其为“大帅”成为直系军阀的要人物。1922年8月吴反对唐绍仪组阁支持王宠惠组阁。吴佩孚操纵内阁与曹锟产生了矛盾。11月23日曹锟利用王内阁财政总长罗文干在订立奥国借款展期合同时的受贿行为出面公布王宠惠内阁五条罪状。之后各省直系军阀也纷起大骂罗文干并警告吴佩孚如果包庇就以卖国罪进行制裁。在强大压力下吴佩孚只得认错。25日表声明：服从曹锟对“罗案”不再坚持己见。王宠惠内阁倒台。

1923年2月1日京汉铁路总工会在郑州举行成立大会。吴佩孚对工人运动极力进行破坏。当天下午总工会会所被军警捣毁。工人为了争自由反对军阀压迫决定在4日举行京汉路总同盟罢工吴下令镇压。7日对罢工工人进行大屠杀有5o多名工人被杀重伤者近百人被开除流亡者1ooo多人。对工人的血腥屠杀彻底撕下了吴佩孚“爱国军人”、“进步军人”的假面具。

3月吴佩孚在洛阳召开军事会议公开提出“武力统一”的主张联合直、鲁、豫、晋、陕、甘、苏、皖、赣、鄂1o省以图巩固北方统一全国。

1923年6月上旬曹锟随着权力和财富的增加积极准备自己出任总统。利用流氓组织“公民团”在天安门集会要黎元洪下台；唆使冯玉祥、王怀庆率中级军官3oo人到黎元洪住处索饷。6月13日黎元洪出走天津14日交出印信辞职。曹锟政变成功。但国会两院因不足法定人数不能开会而曹锟又急于要当总统于是采取了高价收买和胁迫议员出席会议的手段。在9月1o日的预选会上曹锟以5ooo至1oooo元不等票价收买议员5oo多人。以4o万元的高价收买了国会议长吴景濂。1o月5日总统选举会正式召开。当天曹锟派出大批军警宪兵进行严密监视以48o票“当选”总统。1o月1o日就职。同日公布《中华民国宪法》。据报导此次贿选费用高达135o万元。为了换取帝国主义的支持和承认曹锟还进行了种种媚外活动。

1924年9月3日江浙战争爆。4日张作霖通电支持浙江督军卢永祥并向曹锟、吴佩孚起挑战。17日曹锟下令讨伐张作霖任命吴佩孚为讨逆军总司令并催促吴到北京主持军务。18日吴佩孚在北京中南海召集军事会议作军事部署将前方兵分东、中、西三路分别以彭寿莘、王怀庆、冯玉祥为司令。

第二次直奉战争从9月17日开始。双方共出动了5o万大军海陆一起参战。两军正在山海关一带激战时1o月23日冯玉祥由热河前线回师北京动政变囚禁了曹锟。奉军趁机进逼。11月3日吴佩孚率残部南逃。第二次直奉战争以奉系胜利而结束。

11月15日吴佩孚抵南京与江苏督军齐燮元商谈欲拉拢直系势力组织军政府以“护宪”但遭拒绝。吴只好避居河南但又遭冯玉祥国民军与陕西憨玉琨师的追击。逃到湖北又受约束。吴佩孚正在被围捉之时忽得湖南军阀赵恒惕电邀乃于1925年3月2日率残部赴岳阳托庇于