以见到信长公最后的身影。料想他已在御殿深处自尽。”
弗洛伊士的《蓬莱史》中则说：“执行这一特别任务的士兵一起进入内部。找到刚洗完脸手。正用手巾擦身的信长。就直接一箭射中其背部。信长拔出箭。拿起一种像刀一的长枪。名叫剃刀的武器迎战。据说战了很久。信长的腕部被弹击伤。就退入自己的房间关上门。在里面切腹了。又有人说他亲在御殿上放火。被活活烧死了。然而因为火势太大。恐怕无法知道他究竟是怎么死的了。”
从明智方的角看。《翁草》中记载说：“信穿白色单衣。先用弓箭迎敌。因弦崩断。便寻枪来战。一个二七八岁的着红衣的女中取来去鞘的十文字枪。信长公持枪跃下广庭。与三人厮杀。三人一直把信长公逼到房间内房间内的蜡烛还没有熄灭。信长公的身影映在障子上。安田作兵卫（即面提到过的天野源右卫门）用长刃的枪照此影穿透障刺去。刺伤了信长公的右腹。信长公遂入寝殿自尽。”
信长在本能寺殒命的时候。其长男织田信忠就下榻在不远处的妙觉寺中。与本能寺直线距不过00米。当时明智军并没有包围妙觉寺。信忠从匆匆赶来的京都所司代村井贞胜父子处的到谋叛的消息。立刻赶往京都二条御所。据说。信忠认为：“谋这等大逆的贼党们。必定已把守了各个要道路口。一旦途中遭遇就不妙了。还是不要作徒劳的移动。”因此没有及时逃往安土或其它坚固的城堡。
条御所是信长一力扶持的诚仁亲王的官邸。修建的相当坚固。信忠退守此的时。身旁从属大概有三到五百人。明智军很快就包围了二条御所。村井贞胜建议先让诚仁亲王一家退出御所。以免遭受池鱼之殃——“京都所司代村井殿与嗣子（指信忠）在一起。依照他的进言。内里的儿子（内里指天皇。内里的儿子即指诚仁亲王）骑在马上。向外面街道上的明智军派遣了使者。质问他们想把自己怎么样。是不是要自己切腹。明智好象无意对殿下有任何举。希望立刻就让殿下离开御所。只是为了防止城介殿下（指信忠）混在其中逃亡。就回复说马和车驾不能离开。内里的儿子到报告后。就带着妻室一起上去他父亲的皇宫了。”（《蓬莱史》）
亲王离开以后。明智军立刻对二条御所发起猛攻。
知道已无幸免之理织信忠及其部下进行了殊死的抵抗。光在大门口就激斗了一两个时。使明智军付出了意料之外的惨重代价。然而众寡之势悬殊。智军终于还是突破大门。把信忠逼退到大殿上。信忠及其兄弟胜长（信长第五子）往来奋战据说信忠精通剑术。连斩明智方数员大将。勇猛仿佛当年的“强情公方”足利义辉。
损失惨重的明军。纷纷爬上二条御所旁太政大臣近卫前久官邸的屋顶。从这里居高临下。向信忠等人发射箭矢和枪弹。这一角度忠军所无法抵挡的。并且器也引燃了御殿的大火于是信忠吩咐部下镰田新介担任自己的介错。他事后揭开走廊的板把自己的遗体藏匿于其下。嘱咐完毕后就切腹自杀了。因信忠的尸体并没有被明智军发现。而是与御殿一起在红莲烈焰中归为灰烬——享年仅二十六岁。
在二条御所的战斗中。信忠方死殁者除了信忠胜长兄弟外。还有信忠的叔父津田又十长利津田勘七津田九郎二郎元嘉津田小藤次等一门。村井父子三人（贞胜贞成传次）。信长奉行众的菅屋长赖福富平左卫门野野村三十郎。马回众的团平八斋藤新五郎井越中毛利新介等。或战死或自尽。
也人侥幸逃了来。其中就包括信长的弟弟大茶人织田有乐斋长益。据说他是从墙壁上架枪的孔洞中钻出去逃生的。为此。《当代记》说长益“为时人所”。
江户期以来一直到昭和时期之小说一般都采用怨作为题材。最重要的就是被解除招德川家康的职务这一点。虽很难辨明真伪。但作为理由。一般认为有几个理由：
智光秀本计划周到细心的招待。但是准备的菜肴中有恶臭的气味(亦有说因准备材料因天气关系发出非腐烂的然味道信长巡查厨房时发现。但不接受光秀解释。夺其飨宴行一职)。信长怒道“你打算拿烂掉的菜来招待吗？”撤掉了菜肴。并罢免了光秀的接待职务。智光秀在平定丹波国的时候。将其母（亦有乳母说）作为人质交给八上城。说服城主波多野兄弟前往长处。然而信长杀害了兄弟俩人。结果在八上城的光秀的母亲也被杀害。
信长下达要将光秀从原封国丹波国转封到尚是毛利氏领土的出云国与石见国。由于之前信长驱逐重臣林通胜与佐久间信。让光秀也有了失领土被驱逐的危机感而心生不满。
此外。在对待长宗部家的立场上。光秀和信长持完全不同的态度。长宗我部元亲之子信亲与光秀麾大将斋藤利三本是远亲光秀利用这一层关系。说服信长招抚长宗我部氏。使其统合四国的军事。从侧翼夹击毛利氏。然而。长宗我部元亲烈火疾风般的四国统一战却引发了信长的不快。他转而支持赞岐的三好康长。还企图让三子信孝入继三好家。派信孝和丹羽长秀准备四国攻略。日后即由信孝接管长宗我部的原领的。〈这点算是比较可靠的。藤利三握有极大的兵力。一旦叛变。光秀势必被牵涉进去。所以在织田信孝其实主从意见相左并没有关系。然而最初是光秀把长宗我部拉上信长的战车的。现在信长一脚把他踹了下去。事先却毫不征求光秀的意见。而且四国攻略也没有光秀的份。这使光秀既恼怒。又恐惧。害怕自己在信长眼中是一枚可以随时放弃的卒子。况且。前此羽柴秀吉自作主张的插手四国事务。派兵攻克了淡路岛。分明是在抢他光秀的风头。而现在自己竟要前往中国的区。听从羽柴秀吉的指挥。这口气可怎么咽的下呀！
由此。光秀倍感耻辱。积怨甚深。但是。积怨说依据大多是在江户时代之后出现的文稿。作为史料非常值的怀疑。
目前对于光秀从何时决定谋反尚未定论。但是在龟山城出兵前。光秀在参拜爱宕神社时所咏歌“时在今日。天下当倾”。似乎